杜祥琬在核武器和强激光技术方面的研究与应用成果，获得国家科技进步一、二等奖，部委级一、二等奖等共十多项。重要奖项包括:
2001年获国家科技进步奖一等奖一项、二等奖两项。
2000年获何梁何利科技进步奖。
1991年，被评为国家有突出贡献的中青年专家，国家863计划先进工作者。
2011年5月被授予中国科协荣誉委员称号。
